Geboren in Boskowitz (heutige tschechische Republik), aufgewachsen in einem traditionell jüdischen Elternhaus, war Spitzer früh vertraut mit den religiösen Schriften des Judentums und engagiert in der zionistischen Jugendbewegung. In Kiel studiert er Indologie, promoviert mit einer Arbeit zum Sanskrit, wird wissenschaftlicher Assistent an der „Preußischen Akadamie der Wissenschaften“.