Nachdem sie einige Jahre lang Erfahrung mit dem Bauen im ländlichen Raum und mit Beteiligungsprozessen bei der Bauausführung gesammelt hatte, war sie von 1945 bis 47 an der Dokumentation der Bauwerke aus Osmanischer Zeit in Anatolien, Thrakien und den Balkanländern beteiligt. 1946 wurde sie Assistentin an der Akademie und nahm auch jedes Jahr an Ausgrabungen teil. Als 1952 der Hohe Rat für Antike Immobilien gegründet wurde, begann sie dort als Berichterstatterin zu arbeiten.

Nachdem Eyüboğlu in den 50er Jahren Bebauungspläne und Rekonstruktionszeichnungen antiker Werke erstellt hatte, tat sie bis 1970 als Architektin Dienst am Direktorium für Antiken und Museen beim Staatlichen Erziehungsministerium. In dieser Zeit initiierte sie die Restauration und Überwachung einer Reihe von Bauwerken, unter anderem im Haremsbereich im Topkapı Serail. Als sie 1976 an die Rekonstruktions- und Denkmals-Direktion in Istanbul (Istanbul Rölöve ve Anıtlar Müdürlüğü) versetzt wurde, übernahm sie die Restaurierung von antiken Werken. Von diesem Institut aus ging sie 1983 in den Ruhestand.

Als eine der ersten Architektinnen der Türkei deckte Eyüboğlu mit ihrer Tätigkeit ein breites Feld ab, angefangen von Architektur, städtebaulicher Planung und Bauausführung über archäologische Grabung und die Dokumentation des kulturellen Erbes der Nation bis hin zum Bereich der Restauration.